突然间，这个世界被分成了四个，景和，妳音，道长，兹穆丽被飞进这四个不同的世界里，而且在这个看起来不一样的世界里，他们遇见了四个怎样看都不对劲的英寿，英寿竟然被分裂成了四个。究其原因是未来人搞的《世界毁灭游戏》，面对英寿和世界的危机，太狸、猫猫、牛牛、狼姐、老爷爷和南瓜熊也参战，在着奇想之外的展开中，黑色的极狐出现了，究竟英寿和世界的命运会如何？
故事发生在东京八丈岛近海，一座将全球各地警方监控相连接的高科技设施——“太平洋浮标”即将启动。为了与欧洲刑警组织管辖的范围联网，来自世界各地的工程师聚集在这里。基于人脸识别的全新“黑科技”也正在测试中……与此同时，柯南一行人前往八丈岛观鲸，途中柯南接到冲矢昴（赤井秀一）的电话，被告知欧洲刑警组织成员在德国遭到琴酒的杀害。为调查真相的柯南潜入“太平洋浮标”。正当工程师们正在为系统启动而展开准备工作时，一桩案件突然发生！一名女工程师被黑暗组织绑架，她手中存有核心技术的U盘也落入了黑暗组织手中！此时，水下传来未知潜水艇逼近的声音，令人毛骨悚然，一个神秘的黑影也正在悄悄接近灰原哀……
